Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSFA2P28290 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSFA2P28290 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms