Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NFKBIAP25963 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms