Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LMO2P25791 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMO2P25791 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMO2P25791 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMO2P25791 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMO2P25791 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LMO2P25791 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LMO2P25791 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms