Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

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Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APCP25054 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APCP25054 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APCP25054 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APCP25054 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APCP25054 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APCP25054 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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