Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KDELR1P24390 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KDELR1P24390 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms