Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HNF1AP20823 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNF1AP20823 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNF1AP20823 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HNF1AP20823 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms