Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BCL3P20749 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCL3P20749 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms