Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMB1P20618 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms