Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DPA1P20036 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms