Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGA2P17301 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms