Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTLA4P16410 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTLA4P16410 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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