Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BMP4P12644 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms