Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NEFHP12036 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms