Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MCF2P10911 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MCF2P10911 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MCF2P10911 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCF2P10911 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCF2P10911 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCF2P10911 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCF2P10911 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCF2P10911 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MCF2P10911 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms