Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms