Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSF3P09919 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3P09919 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3P09919 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3P09919 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3P09919 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSF3P09919 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CSF3P09919 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms