Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLPSP04118 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPSP04118 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPSP04118 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms