Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOC1P02654 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOC1P02654 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
APOC1P02654 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
APOC1P02654 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOC1P02654 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms