Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-DQB1P01920 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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