Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
C6orf47O95873 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C6orf47O95873 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms