Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABARAPO95166 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms