Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA4O75676 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms