Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NIPSNAP2O75323 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms