Protein–RNA interactions for Protein: O60739

EIF1B, Eukaryotic translation initiation factor 1b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF1BO60739 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EIF1BO60739 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EIF1BO60739 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms