Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMARCA5O60264 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms