Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EDIL3O43854 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms