Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR3O43761 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms