Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DENRO43583 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DENRO43583 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DENRO43583 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DENRO43583 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DENRO43583 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DENRO43583 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DENRO43583 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms