Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRRTM2O43300 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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