Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms