Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APAF1O14727 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
APAF1O14727 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms