Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP17L12C9JPN9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USP17L12C9JPN9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms