Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ERVV-1B6SEH8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ERVV-1B6SEH8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms