Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms