Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms