Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C4orf47A7E2U8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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