Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIMBP3BA6NNM3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIMBP3BA6NNM3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms