Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD3A6NKT7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RGPD3A6NKT7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms