Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CFAP73A6NFT4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms