Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF22A3QJZ6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms