Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUBP2Q9Y5Y2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms