Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX9Q9Y5X1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX9Q9Y5X1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms