Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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SNX13Q9Y5W8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNX13Q9Y5W8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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