Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPS28Q9Y2Q9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms