Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM2AQ9Y2K7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms