Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC2Q9Y235 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms