Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ERVW-1Q9UQF0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERVW-1Q9UQF0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms