Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NEU3Q9UQ49 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms