Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AGAP1Q9UPQ3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AGAP1Q9UPQ3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms