Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX12Q9UMY4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms